我們在前幾個禮拜有貼出一篇美國FDA針對體外診斷醫材(IVD)的測試要求(請看這篇)。FDA在美國時間2020年3月16日又提供了更多體外體斷醫材測試的問題回答集資訊。我們在這篇將為有興趣開發或了解新冠病毒的IVD廠商或人員提供更多的資訊。開發COVID-2019的檢測技術是目前許多廠商或研究人員很感興趣的話題。美國FDA和CDC在這波抗疫的過程中，網站其實更新的不算慢，但整個政府的防疫動作很明顯的慢半拍，但畢竟還是美國，FDA所公告的指引還是具有指標性，針對上篇的新冠病毒體外診斷最低要求指引後，很多廠商在線上會議提出很多問題，FDA便在這個問題集提供了重要情報。
美國FDA在數周前提供了一份即生效的指引(中文請看這篇):
Policy for Diagnostics Testing in Laboratories Certified to Perform High Complexity Testing under CLIA prior to Emergency Use Authorization for Coronavirus Disease-2019 during the Public Health Emergency
執行高複雜性檢測的CLIA認證實驗室在獲得緊急使用授權(EUA)之前，執行臨床分子診斷測試的政策
有需要廠商和相關研究人員，對這份指引相當有興趣。因為這是第一份美國FDA和COVID-19有關係的指引，教導廠商開發IVD時需要做到的最低要求。當然在線上視訊會中，許多廠商有非常多的問題，所以FDA將這些問題整理起來，並一一回答以解答廠商常會想問題想問的問題。
我們來看看有哪些問題吧。FDA將這些問題分成四種類型，我們在這邊選出對開發廠商感興趣的十三個重要問題
一.一般問題
- 有哪些美國的實驗室可以按照此指引進行COVID-19檢測?
- 請問是否需要對至少兩個以上的病毒靶點(viral target)進行RT-PCR測試法驗證?
- 我們正在開發COVID-19的檢測方法。該方法是在已經被緊急使用授權(EUA)的檢測方法做調整。我需要全部從頭做驗證(validation)嗎?還是驗證橋接試驗即可?
- 我們正在開發COVID-19的檢測方法並且想要索取美國首例(該病人在華盛頓州被檢測出)的新冠病毒的RNA基因組來驗證我的測試。我們應該怎麼做?
- 請問FDA建議新開發的新冠病毒測試方法的最低要求是什麼?
- 我們在FDA指引出來前就有申請到EUA模版。該模版要求要做50個臨床樣本但新的指引要求30個即可，請問哪個正確?
- 我們正在開發COVID-19的檢測方法並且想要申請EUA。請問我們需要完成所有驗證送件後才能申請EUA嗎?
二.假如我沒有…該怎麼辦
- 假設我們無法取得病毒採樣組(VTM/UTM)來協助我們收集及運送我們的病毒樣本，請問有沒有替的方法?
- 假如我們沒有使用美國疾管局EUA授權的箤取平台(extraction platform)?
- 假如我們沒有檢測法的正控制材料，我們應該如何取得?
- 假如我們沒有人體萃取控制材料，我們應該如何取得?
三.臨床實驗室問題略過四.測試套件(Test kit)製造商問題
- 我們是開發新冠病毒測試套件給臨床實驗室的廠商。我們可以按照該指引嗎?
- 我們是開發新冠病毒測試套件給臨床實驗室的廠商。我們可以使用”加速”EUA申請模版嗎?
一. 一般問題
1.有哪些美國的實驗室可以按照此指引進行COVID-19檢測?
早在數周前FDA還只有一兩個單位可以進行檢測，但這幾天美國案子開始瘋狂增加，川普甚至下達國家緊急狀態，應該是把美國人嚇到了。幾天內，FDA馬上多出很多檢測單位替民眾提供檢測。目前除了使用緊急使用授權EUA的IVD外(像美國疾管局CDC核可實驗室、羅氏、Thermofisher等)外，
https://www.fda.gov/medical-devices/emergency-situations-medical-devices/emergency-use-authorizations#coronavirus2019
還有下面這些單位:
- AdventHealth
- ARUP Laboratories
- Baylor Scott and White Medical Center – Temple
- BioReference Laboratories
- The Children’s Hospital of Philadelphia
- HMH Hackensack University Medical Center
- Hospital of the University of Pennsylvania
- Johns Hopkins Medical Microbiology Laboratory at Johns Hopkins Hospital
- Laboratory Corporation of America
- Montefiore Medical Center
- New York Presbyterian Hospital -Weill Cornell Medicine (NYPH-WCM)
- NYU Langone Medical Center
- Quest Diagnostics Infectious Disease, Inc.
- Stanford Health Care Clinical Laboratory
- Texas Children’s Hospital Department of Pathology
- UCSF-Health
- University of Washington
- Viracor Eurofins Clinical Diagnostics
2. 請問是否需要對至少兩個以上的病毒靶點(viral target)進行RT-PCR測試法驗證?
根據目前的證據和經驗，一個即可。指引中也包含了最少最低測試要求。
3. 我們正在開發COVID-19的檢測方法。該方法是在已經被緊急使用授權(EUA)的檢測方法做調整。我需要全部從頭做驗證(validation)嗎?還是驗證橋接試驗即可?
根據指引，若新的檢測方法有對核可的EUA測試進行驗證過的橋接試驗，則FDA不傾向拒絕此新的或修改過的EUA檢測方法。更多橋接試驗建議請參考FAQ。
4. 我們正在開發COVID-19的檢測方法並且想要索取美國首例(該病人在華盛頓州被檢測出)的新冠病毒的RNA基因組來驗證我的測試。我們應該怎麼做?
你們可以試著和BEI Resource要要看。請點這裡。
5. 請問FDA建議新開發的新冠病毒測試方法的最低要求是什麼?
請參考指引 (愛姆斯的Team之前有翻，請看這篇)
6. 我們在FDA指引出來前就有申請到EUA模版。該模版要求要做50個臨床樣本但新的指引要求30個即可，請問哪個正確?
FDA修改了要求，30個即可。更多資訊，請看這篇
7. 我們正在開發COVID-19的檢測方法並且想要申請EUA。請問我們需要完成所有驗證送件後才能申請EUA嗎?
不用，FDA更傾向在研發前期和開發者討論其開發內容。FDA鼓勵廠商準備好資訊寄到:CDRH-EUA-Templates@fda.hhs.gov 與FDA進行EUA預討論。
二.假如我沒有…該怎麼辦
1.假設我們無法取得病毒採樣組(VTM/UTM)來協助我們收集及運送我們的病毒樣本，請問有沒有替的方法?
雖然VTM/UTM是偏好的方式。但下面的替代方式是FDA也可接受的取樣組:
a. Liquid Amies-based transport media.
- 供應商:
- E-Swab by Copan (Catalogue # 481C and 482C) with regular or flex minitip applicator
- Opti-Swab by Puritan (Catalogue # LA-117), swab included in kit (Catalog#3317-H).
- 儲存條件: Up to 72 hours at 4℃, or frozen for longer storage.
若以上還是沒法取得，請用下面方法取樣後進行RT-PCR
b.Dry swab in saline
- 供應商:
- Puritan: 25-3317-H, 25-3316-U, 25-3316-H, 25-3317-U, 25-3318-U, 25-3318-H, 25-3319-H, 25-3320-U, 25-3320-U EMB 100MM, 25-3320-U EMB 80MM, 25-3320-H and 25-3320-H EMB 80MM
- Copan: 501CS01, 503CS01, 516CS01, 518CS01 and 534CS01
- 儲存條件
- : Up to 72 hours at 4℃, or frozen for longer storage.
請注意CDC不建議使用藻酸鈣棉籤或帶有木柄的棉籤，因為它們可能含有降低病毒活性並抑制PCR測試的物質。FDA會持續更新這部份訊息
2. 假如我們沒有使用美國疾管局EUA授權的箤取平台(extraction platform)?
FDA認為CDC EUA授權測試可以用在以下箤取平台(更多資訊請見官網):
- Roche MagNA Pure LC
- Roche MagNA Pure Compact
- Roche MagNA Pure 96
- QIAGEN QIAcube
- QIAGEN
- QIAGEN EZ1 Advanced XL
- QIAGEN EZ1 Advanced XL
- bioMérieux NucliSENS easyMAG Instrument
- bioMérieux EMAG Instrument
3. 假如我們沒有檢測法的正控制材料，我們應該如何取得?
a.取得針對CDC EUA設計的N1/N2 正向控制 (更多細節請看官網)。b.取得針對CDC EU設計的RNA酶P (RP)控制組(更多細節請看官網)
4. 假如我們沒有人體萃取控制材料，我們應該如何取得?
人體RNA可從人體標本，或人體細胞培養箤取出來，並用做HSC控制。HSC應產生正結果而新冠病毒則為負結果。
三.臨床實驗室問題
由於此部份是針對美國境內臨床實驗室要怎麼使用合格的測試組，所以我們這部份先忽略。如果有興趣，歡迎和我們討論。
四.測試套件(Test kit)製造商問題
1. 我們是開發新冠病毒測試套件給臨床實驗室的廠商。我們可以按照該指引嗎?
此指引其實也提供資訊給測試套件的製造商和經銷商。廠商透過EUA流程和FDA進行合作及審查。
2. 我們是開發新冠病毒測試套件給臨床實驗室的廠商。我們可以使用”加速”EUA的申請模版
加速EUA模版是針對給CLIA實驗室的。製造商請使用EUA模版
