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【重要資訊】美國首次公告新冠病毒檢測方式要求

by 愛姆斯

指引名稱:Policy for Diagnostics Testing in Laboratories Certified to Perform High Complexity Testing under CLIA prior to Emergency Use Authorization for Coronavirus Disease-2019 during the Public Health Emergency執行高複雜性檢測的CLIA認證實驗室在獲得緊急使用授權(EUA)之前,執行臨床分子診斷測試的政策

簡介
如果你們是在體外診斷醫材公司上班,並且有興趣開發新冠病毒診斷醫材、如果你是在臨床診斷實驗室工作、如果你是相關醫護人員想了解美國對診斷器材的最低要求,那這個指引其實很值得你花時間去了解。愛姆斯因為離開PCR有些時間,所以盡最大力去翻譯和解讀,有錯的話歡迎提出討論。
美國FDA這兩天發佈了一項個人覺得極度重要的指引,雖然這個指引是針對CLIA實驗室*(見下面註解)且主要是在美國。但這應該是美國針對新冠肺炎的第一個相關指引,而且當中不是只有提供重要的資訊給想要開發檢測方式或執行檢測的CLIA實驗室,實際上對體外診斷製造商或開發廠商也是非常重要,當中提及的條件和要求也代表著FDA對此病毒的檢測方式的最低和基本要求:
★該指南包括有關最低的測試要求所需要做的事1.偵測極限(LoD)2.臨床評估3.包容性4.交叉反應
FDA並在美東時間3月2日下午三點提供一個關於此指引的線上視訊會。

*CLIA是什麼?診斷測試可以幫助醫護人員監控或過篩疾病,產出的資訊也同時幫助醫護人員做臨床判讀。CLIA實驗室是被法規規範的實驗室,這些實驗室必須合規後才能拿到Center for Medicare and Medicaid Services (CMS) 所核發的證書。拿到證書後它們才能執行人體樣本並進行檢測。實驗室可以依照能執行的檢測類型申請不同的CLIA證書。下面三個單位共同管理CLIA,它們分別有不同的職責和功能:The Food and Drug Administration (FDA), Center for Medicaid Services (CMS),Centers for Disease Control and Prevention (CDC).■指引目的解釋在突發公共衛生事件期間新冠病毒疫情期間,執行高複雜性檢測的CLIA認證實驗室在獲得緊急使用授權之前,執行臨床分子診斷測試的政策。


背景美國時間2020年2月29日,美國FDA發布的指南描述了有關以下的政策:-特定實驗室立即使用他們開發並經過驗證的測試,以完成更多且更快的檢測-為了應對新冠病毒公共衛生突發事件,FDA已確定事情之急迫性,而直接生效此指引。換句話說就是美國的檢測單位極度不夠,FDA必須讓更多的實驗室能夠協助檢測新冠病毒!


指引範圍
1.新政策僅限於:
-符合CLIA要求且可以執行高複雜度測試的CLIA認證實驗室
-SARS-CoV-2的分子診斷 (SARS-CoV-2就是新冠病毒或武漢病毒)
2.新政策不影響:-CLIA的基本要求-CDC建議的接受測試對象所以不是阿貓阿狗實驗室都可能做,是CLIA而且要能執行高複雜的檢測實驗室,所有CLIA的基本要求全不能少!

指引所提到的政策是什麼?此指引包括以下的建議:
•在臨床使用之前,必須驗證新開發SARS-CoV-2的檢測方式
•在臨床上開始使用驗證過的檢測時,必須通知FDA
•在EUA授權檢測時,需確認前5個陽性和陰性樣品
•在測試報告中指出測試已通過驗證但未來仍待FDA完成審查
•在開始檢測的15天內提交EUA
•若有任一樣本未通過有效檢測( fail confirmatory testing)或FDA無法給予EUA,所需做的事


★★★檢測驗證
•該指南包括有關最低的測試要求所需要做的事
1.偵測極限(LoD)
2.臨床評估
3.包容性
4.交叉反應
•官方能提供有限的病毒–在實驗室準備好驗證時,FDA、BARDA和CDC會優先安排和運送至相關實驗室

1.偵測極限(LoD)
• FDA建議實驗室記錄其SARS-CoV-2的偵測極限(LoD)分析。
•定義為19/20重複下陽性的最低濃度
• 方法:
–建議檢測數個稀釋系列,每個濃度重複3次(測距),以及
–確認20次重複後的最終濃度(大約最初界定的LOD)FDA建議實驗室測試每個濃度三個重複的稀釋系列,並且重複20次,確認最終濃度。FDA將LoD定義為19/20重覆下陽性時的最低濃度。
•樣品:
–如果要使用多種樣本類型,則最具挑戰性的種類需要被評估(例如痰)

2.臨床評估
•建議至少測試30個反應樣本和30個非反應樣本-反應性標本可以是摻入病毒RNA(spiking viral RNA)或將活性減毒病毒進入剩餘的臨床標本–應將20個人造樣本加(spike)到1x-2x LoD的濃度,其餘樣品跨越分析測試範圍(with the remainder of specimens spanning the assay testing range.)。
•可接受的性能:–在1x-2x LoD  (95%的一致性),以及–在所有其他濃度和陰性樣本中達100%一致性
在缺乏已知的陽性樣品進行測試的情況下,FDA建議實驗室透過測試至少30個人為設計的反應性標本和30個非反應性標本來確認其效果。人為反應性標本可以通過將Spiking RNA或活性減毒病毒摻入剩餘的臨床標本中來製作,其中多數可能是殘留的上呼吸道的樣本,例如NP SWAP或下呼吸道標本,例如痰等。應將20個人為製作的臨床樣本必須Spike在濃度1x-2x LoD,其餘樣本分析檢測範圍。
FDA將能接受標準定義在1x-2x LoD的95%一致性,並且在所有其他濃度和陰性樣品中具100%一致性。

3.包容性
•建議執行電腦分析檢體與公佈的新冠病毒序列穩和度百分比。
•100%已發布的SARS-CoV-2序列應讓能被選定的引子和探針偵測到

4.交叉反應
•建議對測定引子及探針與常見呼吸道菌群和其他病毒病原體進行電腦分析比對
•任一引子/探針和目標微生物中的任何序列應有> 80%的同源性
•建議遵循公認的實驗室流程進行額外的交叉反應性測試  

目前EUA授權情形
•CDC在2020年2月4日獲得的EUA授權
–目前合格的批次為CDC的IDT 2019-nCoV套件,批號#0000500383
–其他的IDT批次正在接受CDC的審查
•紐約州沃茲沃思中心(NYS Wadsworth Center)在2020年2月29日獲得的EUA授權資格
•CDC,FDA和BARDA與多家IVD製造商合作,以儘快增加其他EUA授權;
EUA授權單位頁面:https://www.fda.gov/medical-devices/emergency-situations-medical-devices/emergency-use-authorizations#coronavirus2019

所以如果你是IVD廠商,正在開發新冠病毒的診斷套件,這是你的機會。因為如果你的產品不差,它可以比傳統流程更快進入市面。所以本指引極其重要,因為指引是FDA的現行思維模式,也是它們對相關單位的最低要求。

EUA提交方式
• 應將經過驗證測試的臨床使用通知寄到CDRH-EUA-Templates@fda.hhs.gov ,且包括以下資訊:
–實驗室名稱
–實驗室主任的姓名-
地址
– 聯繫人
• EUA應在開始臨床測試後15天內提交給OIR-Operations@fda.hhs.gov ,應包括:
–表格3514https://www.fda.gov/downloads/AboutFDA/ReportsManualsForms/Forms/UCM080872.pdf
–完整的EUA模板,https//www.fda.gov/media/135658/download
參考指引: https://www.fda.gov/media/135659/download

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